Prevalence of bovine norovirus and nebovirus and risk factors for infection in Swedish dairy herds
Bovina norovirus och nebovirus - prevalens och riskfaktorer för infektion i svenska mjölkkobesättningar
Aim of the study was to determine the prevalence of bovine norovirus and nebovirus infections in dairy calves in Sweden. A secondary aim was to analyse herd and management factors associated with these infections. In this study, samples and data collected for another study in 2005-2007 were used (Silverlås et al. 2009. Prev. Vet. Med. 90, 242-253). The samples and data were originally collected for studying Cryptosporidium infections. Fecal samples from 5 calves 2-30 days of age were collected by a veterinarian visiting each farm once, in total 50 farms. For the present study, samples were analysed by RT-PCR for bovine norovirus and nebovirus. For specification of the methods, see the published paper. The management data were collected at the farm visits by observation and interview of farmers using a standardized questionnaire.
The dataset contains the results of RT-PCR analyses of fecal samples from young calves for bovine norovirus and nebovirus. Five calves per herd in 50 Swedish dairy herds were included in the study. The dataset also includes information about the herd, i.e. herd size, average yearly production and a number of variables concerning management of calvings and calves. Such management routines could influence the level of calf health and transmission of infections. These data were gathered through standardized interviews with the farmers. Data compiled in two separate files, calf level data (individual), 250 rows + heading, herd level data, 50 rows + heading.
Studiens syfte var att bestämma prevalensen för bovint norovirus och nebovirus hos kalvar i svenska mjölkkobesättningar. Ett andra syfte var att analysera besättnings- och skötselfaktorer associerade med dessa infektioner. I studien användes prover och data insamlade i en tidigare studie 2005-2007 (Silverlås et al. 2009. Prev. Vet. Med. 90, 242-253). Prover och data samlades ursprungligen in för att studera cryptosporidieinfektioner. Träckprover från 5 kalvar 2-30 dagar gamla togs av veterinär vid ett besök på varje gård, totalt 50 gårdar. För den här studien analyserades proverna med RT-PCR för bovint norovirus och nebovirus. För mer information om metoderna, se den publicerade artikeln. Skötsel- och besättningsdata samlades in vid besättningsbesöket genom observationer och intervju av lantbrukaren via ett standardiserat frågeformulär.
Datasetet innehåller analyssvar från RT-PCR för bovint norovirus och nebovirus i träckprover från 5 unga kalvar /besättning i 50 svenska mjölkkobesättningar. Datasetet innehåller också uppgifter om besättningarna, såsom besättningsstorlek, årlig medelproduktion och ett antal variabler som beskriver rutiner runt skötsel av kalvningar och kalvar, vilka kan ha betydelse för kalvhälsan och smittspridning. Dessa data har samlats in via ett standardiserat intervjuformulär. Data uppdelade på två filer, data på kalvnivå (individ), 250 rader + rubrik, data på besättningsnivå, 50 rader + rubrik.
2022-02-28T13:14:26.360121Z
2022-02-28T13:14:26.360121Z
Madeleine Tråven
Charlotte Axén
arkiv@slu.se
arkiv@slu.se
Madeleine Tråven
Madeleine Tråven
Agricultural and Veterinary sciences
Lantbruksvetenskap och veterinärmedicin
Clinical Science
Klinisk vetenskap
Other Veterinary Science
Annan veterinärmedicin
Farming
Areella näringar
Veterinary Science
Veterinärmedicin
Cattle Diseases
Nötkreatursjukdomar
Agricultural and aquaculture facilities
Jordbruks- och vattenbruksanläggningar
calves (bovine)
kalvar (nötdjur)
colostrum
råmjölk
risk factors
riskfaktorer
diarrhea
diarré
Animal Diseases
Djursjukdomar
digestive system diseases
matsmältningsorganens sjukdomar
role related to effect
roll relaterad till effekt
milk (secretions)
mjölk (sekret)
bovine
nötdjur
diseases
sjukdomar
secretions
sekret
bovine animals
nötkreatur
role
roll (uppgift)
Bovidae
slidhornsdjur
biological phenomena
biologiska fenomen
matter
materia
properties
egenskaper
physical objects
fysiska objekt
phenomena
fenomen
ruminants
idisslare
events and action
händelser och handling
objects
entiteter
Artiodactyla
partåiga hovdjur
mammals
däggdjur
vertebrates
ryggradsdjur
Chordata
ryggsträngsdjur
animals
djur
eukaryote
eukaryoter
organisms
organismer
organic objects
organiska objekt
bovine norovirus
bovint norovirus
RT-PCR
RT-PCR
nebovirus
nebovirus
calf health
kalvhälsa
dairy herds
mjölkkobesättningar
management routines
skötselrutiner
2005
2007
Swedish University of Agricultural Sciences
Sveriges lantbruksuniversitet
Sweden
Sverige