A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus
X-inaktivering under T-cellsutvecklingen i thymus
The aim of the study was to investigate X-inactivation during human T-cell development in the thymus. Thymocytes from six different developmental stages from seven individuals were isolated and studied regarding gene expression. The data set contains data from RNA sequencing, DNA methylation and whole exome sequencing.
The dataset contains data from the manuscript "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" by Gylemo et al, and consists of results from RNA sequencing (fastq.gz), analysis of DNA methylation (Grn.idat) and whole exome DNA sequencing (fastq.gz) of six developmental stages of thymocytes from seven individuals.
The data is described on individual and cell-type level in the tab-separated metadata files (.tsv).
MD5 checksums for each file are included.
Huvudsyftet med studien har varit att studera X-inaktivering under T-cellsutveckling i human thymus. I studien har sex olika utvecklingsstadier av thymocyter isolerats från sju individer och studerats avseende genuttryck. Datamaterialet innehåller data från RNA-sekvensering, DNA-metylering och helexom-sekvensering av DNA.
Datasetet innehåller data från manuskriptet "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" av Gylemo et al och innehåller resultat från RNA-sekvensering (fastq.gz), analys av DNA-metylering (Grn.idat) och DNA-exomsekvensering (fastq.gz) av sex olika mognadsstadier av thymocyter från totalt sju individer.
Data är beskrivna på individ- och celltypsnivå i de bifogade tabbseparerade metadatafilerna (.tsv).
Kontrollsummor i MD5-format för datafilerna finns tillgängliga.
2022-09-21T10:43:19.42057Z
2022-09-06T07:25:37.406026Z
Olov Ekwall
Immunology in the medical area
Immunologi inom det medicinska området
Basic Medicine
Medicinska och farmaceutiska grundvetenskaper
Medical and Health Sciences
Medicin och hälsovetenskap
Hemic and Immune Systems
Blod- och immunsystem
Immune System
Immunsystem
Cardiovascular Surgical Procedures
Kardiovaskulära kirurgiska ingrepp
T-Lymphocytes
T-lymfocyter
Thymus Gland
Bräss
Thymocytes
Tymocyter
Lymphocytes
Lymfocyter
Lymphoid Tissue
Lymfvävnad
Surgical Procedures, Operative
Kirurgiska ingrepp
Precursor Cells, T-Lymphoid
Pre-T-celler
Leukocytes, Mononuclear
Leukocyter, mononukleära
Lymphatic System
Lymfatiska systemet
Tissues
Vävnader
Lymphoid Progenitor Cells
Lymfoida progenitorceller
Leukocytes
Vita blodkroppar
Hematopoietic Stem Cells
Blodstamceller
Blood Cells
Blodceller
Bone Marrow Cells
Benmärgsceller
Stem Cells
Stamceller
Blood
Blod
Cells
Celler
Hematopoietic System
Hematopoetiska systemet
Body Fluids
Kroppsvätskor
Fluids and Secretions
Kroppsvätskor och sekret
University of Gothenburg
Göteborgs universitet
Sweden
Sverige