Skapare/primärforskare
David Hall
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Jenny Olsson - Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Wei Zhao
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Johan Kroon - Skogforsk
Ulfstand Wennström - Skogforsk
... Visa mer..Beskrivning
Språk
Engelska
Forskningshuvudman
Ansvarig institution/enhet
Ekologi Miljö och Geovetenskap
Data innefattar personuppgifter
Nej
Tidsperiod(er) som undersökts
1985 – 2017
Geografisk utbredning
Geografisk plats: Nordeuropa
Geografisk beskrivning: Datat kommer från tallfrö som insalmlats i Norge, Sverige, Finland, Archangelsk- och Komi- regionerna i Ryssland
Forskningsområde
Bioinformatik (beräkningsbiologi), Genetik, Evolutionsbiologi, Skogsvetenskap
(Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)
Biologi och ekologi, Geovetenskap, Miljö, Positionering
(INSPIRE ämnesklassificering)
Hall et al. 2021. Divergent pattern between phenotypic and genetic variation in Scots pine. Plant Communications
DOI:
https://doi.org/10.1016/j.xplc.2020.100139
Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.
Ladda ner data
Tillhörande dokumentation
Beskrivning
Basparsvarianter för 935 Pinus sylvestris baserat restriktionsezyms sekvensering på Illumina HiSeq X platform. Textfil i form av gzipped vcf (.vcf.gz). Se "pheno_pop.txt" för information om varje individ.Version 1
https://doi.org/10.5878/8bg9-ah89
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Text
Skapare/primärforskare
David Hall
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Nyckelord
genetic population structure, population structure, population genetics, gbs, pinus sylvestris, tall
Variabler
11039
Ladda ner data
Tillhörande dokumentation
Beskrivning
Text fil enligt vcf format som är komprimerad med GNU zip (.vcf.gz). Se "pheno_pop.txt" för information om varje individ.Version 1
https://doi.org/10.5878/rjzz-jk23
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Text
Skapare/primärforskare
David Hall
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Nyckelord
genetic population structure, population structure, population genetics, gbs, pinus sylvestris, tall
Variabler
10925
Ladda ner data
Tillhörande dokumentation
Beskrivning
Den uppmätta normaliserade skadegraden hos varje fröplanta efter exponering för köld. Innehåller även populationsnummer och såddnummer.Version 1
https://doi.org/10.5878/0msc-3v36
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Numeriska
Text
Skapare/primärforskare
David Hall
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Nyckelord
genetic population structure, population structure, population genetics, gbs, pinus sylvestris, tall
Variabler
4
Ladda ner data
Tillhörande dokumentation
Beskrivning
Miljövariablerna extraherades för varje population från miljöskikt med hög spatial upplösning, baserat på deras populationerna härkomstslatitud och -longitud. Dessa variabler användes sedan för fenotyp- och genotyp-miljöassociationsanalyser. En beskrivning av alla variabler finns i Tabell S2 i “Document S1. Supplemental methods, Supplemental Figures 1–4, and Supplemental Tables 1–6.”, tillgänglig från doi.org/10.1016/j.xplc.2020.100139Version 1
https://doi.org/10.5878/45yn-ag55
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Numeriska
Text
Skapare/primärforskare
David Hall
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Nyckelord
genetic population structure, population structure, population genetics, gbs, pinus sylvestris, tall
Variabler
72
Ladda ner data
Tillhörande dokumentation
Beskrivning
Fröplantornas skadegrad (Damage) skattades till ett värde mellan 0 (ingen skada) till 6 (död) denna skadegrad normaliserades sedemera med ranknormalisering (DamageN) över alla replikat (Repl).Version 1
https://doi.org/10.5878/7pt2-ja36
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Numeriska
Text
Skapare/primärforskare
David Hall
- Umeå universitet, Ekologi Miljö och Geovetenskap
Nyckelord
genetic population structure, population structure, population genetics, gbs, pinus sylvestris, tall
Variabler
18