Skapare/primärforskare
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Anna-Maria Eisele
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Sarah Hanzén
- Cochlear Nordic AB
Katarina Vielfort
- Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi
David Öling
- AstraZeneca, Mölnlycke, Sweden, Discovery Biology, Discovery Sciences, Innovative Medicines and Early Development Biotech Unit
Beskrivning
Språk
Engelska
Forskningshuvudman
Ansvarig institution/enhet
Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Data innefattar personuppgifter
Nej
Analysenhet
Population
Saccharomyces cerevisiae (bagarjäst)
Studiedesign
Experimentell studie
Preklinisk studie
Urvalsmetod
Tidsperiod(er) som undersökts
2012 – 2020
Sortera på namn | Sortera efter år
Andersson R, Eisele-Bürger AM, Hanzén S, Vielfort K, Öling D, Eisele F, Johansson G, Gustafsson T, Kvint K, Nyström T. Differential role of cytosolic Hsp70s in longevity assurance and protein quality control. bioRxiv. 2020 Jun 29. Available from: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.06.25.170670v2.full
DOI:
https://doi.org/10.1101/2020.06.25.170670
Andersson R, Eisele-Bürger AM, Hanzén S, Vielfort K, Öling D, Eisele F, et al. (2021) Differential role of cytosolic Hsp70s in longevity assurance and protein quality control. PLoS Genet 17(1): e1008951.
DOI:
https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1008951
Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.
Ladda ner data
Beskrivning
Fluorescensmikroskopi av levande jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Jästen är odlad i rikt medium (YP) med 2 % glukos som kolkälla. Alla avbildade stammar producerar det felveckade markörproteinet gus1-3-GFP eller metacaspaset Mca1 taggat med GFP (Mca1-GFP).Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
Version 1
https://doi.org/10.5878/8wxm-8r38
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Sarah Hanzén
- Cochlear Nordic AB
Katarina Vielfort
- Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Fluorescensmikroskopibilder av levande jästceller i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före stress, direkt efter 30 minuters värmestress samt 20, 40 och 60 minuter efter värmestress. Jästen är odlad i komplett syntetiskt medium med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP.Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
Version 1
https://doi.org/10.5878/8r0v-jk54
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Fluorescensmikroskopibilder av levande jästceller i mitten av den exponentiella tillväxtfasen, före och efter 30 minuter värmestress. Jästen är odlad i rikt medium (YP) med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar Hsp70 chaperonproteinet Ssa4 taggat med GFP (Ssa4-GFP) och metacaspaset Mca1 taggat med RFP (Mca1-RFP).Datasetet är insamlat genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
Version 1
https://doi.org/10.5878/hvf7-3j18
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Katarina Vielfort
- Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Fluorescensmikroskopi av levande jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före och efter 30 minuter värmestress. Jästen är odlad i syntetiskt medium utan histidin med 2 % galaktos som kolkälla. Alla avbildade stammar bär på en plasmid som uttrycker GFP-HSP104 under kontroll av en GAL-promotor.Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
Version 1
https://doi.org/10.5878/gv2g-xc30
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Sarah Hanzén
- Cochlear Nordic AB
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Bildsekvens av jästceller under återhämtning från 30 minuters värmestress. Jästen har odlats i komplett syntetiskt media med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP. Datasetet inhämtades genom fluorescensmikroskopi var 10:e minut av samma jästceller under 2 timmar.Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
Version 1
https://doi.org/10.5878/wj4m-y925
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Sarah Hanzén
- Cochlear Nordic AB
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Fluorescensmikroskopi av levande jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före och efter 30 minuter värmestress. Jästen är odlad i syntetiskt medium utan histidin och leucin med 2 % galaktos som kolkälla. Alla avbildade stammar bär på två plasmider; en som uttrycker GFP-HSP104 under kontroll av en GAL-promotor samt en som uttrycker SSA1, SSA4 eller SSA1/SSA4 chimärer (alternativt en tom plasmid) under kontroll av en GPD-promotor.
Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bild
Version 1
https://doi.org/10.5878/mez1-3z30
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Sarah Hanzén
- Cochlear Nordic AB
Katarina Vielfort
- Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Beskrivning
Fluorescensmikroskopi av levande jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före, efter 30 minuter värmestress samt 40 minters återhämtning efter stress. Jästen är odlad i syntetiskt medium utan uracil med 2 % glukos som kolkälla. Alla avbildade stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP och bär på en plasmid som uttrycker SIK1-RFP under kontroll av en GPD-promotor. Innan avbildning har cellerna färgats med DAPI.
Datasetet hämtades in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfil
Version 1
https://doi.org/10.5878/3cxh-6367
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Fluorescensmikroskopibilder av levande jästceller i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Jästen är odlad i komplett syntetiskt medium med 2 % glukos som kolkälla. Alla stammar producerar det felveckade markörproteinet guk1-7-GFP.Datasetet har samlats in genom fluorescensmikroskopi.
Bildfilerna är i Carl Zeiss Image-format (.czi).
Version 1
https://doi.org/10.5878/d0ya-5n21
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Katarina Vielfort
- Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
WT ssa12DD and ssa12DDSSA4OE: Western blots av SDS-PAGE geler med proteinextrakt från jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Jästen är odlad i komplett syntetiskt media med 2 % glukos som kolkälla.
WT ssa12DD w chimaera plasmids: Western blots av SDS-PAGE geler med proteinextrakt från jäst i mitten av den exponentiella tillväxtfasen före och efter 30 minuters värmestress. Jästen är odlad i komplett syntetiskt media utan leucin med 2 % glukos som kolkälla.
Bilderna är inskannade west
Version 1
https://doi.org/10.5878/rq33-3f44
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Immunocytofluorescensbilder av jästceller som fixerats i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Cellerna har färgats med antikroppar mot Hsp42 (primär antikropp: kanin anti-Hsp42, sekundär antikropp: get anti-kanin AlexaFlour488) och kontrastfärgats med DAPI (dataset från 170505 och 170608), antikroppar mot aktin (dataset från 170518) (primär antikropp: mus anti-Act1, sekundär antikropp: get anti-mus Alexa Flour568) eller nukleoporinkomplexet (dataset från 170608) (primär antikropp: mus anti
... Visa mer..Version 1
https://doi.org/10.5878/a3kq-6708
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
Katarina Vielfort
- Umeå universitet, Institutionen för molekylärbiologi
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Ladda ner data
Beskrivning
Bilder av tvådimensionella proteingeler med proteinextrakt från vildtyp och Hsp70-mutanta jäststammar i mitten av den exponentiella tillväxtfasen. Jästen har odlats i rikt medium (YP) med 2 % glukos som kolkälla.Datasetet insamlades via fotografering av tvådimensionella proteingeler.
Bildfilerna är i TIFF-format.
Version 1
https://doi.org/10.5878/9xxe-g981
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Stillbild
Skapare/primärforskare
David Öling
- AstraZeneca, Mölnlycke, Sweden, Discovery Biology, Discovery Sciences, Innovative Medicines and Early Development Biotech Unit
Rebecca Andersson
- Göteborgs universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi
Thomas Nyström
- Göteborgs Universitet, Institutionen för biomedicin, Avdelningen för mikrobiologi och immunologi