Skapare/primärforskare
Olov Ekwall
- Göteborgs universitet, Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik
Beskrivning
Språk
Engelska
Forskningshuvudman
Ansvarig institution/enhet
Institutionen för kliniska vetenskaper
Övriga forskningshuvudmän
Medverkande
Colm E Nestor
- Linköpings universitet, Institutionen för biomedicinska och kliniska vetenskaper, Avdelningen för barns och kvinnors hälsa
Finansiering 1
- Finansiär: ALF Västra Götalandsregionen
- Diarienummer hos finansiär: ALFGBG-965795
- Projektnamn på ansökan: Kliniska och experimentella studier av toleransmekanismer i thymus
Finansiering 2
-
Finansiär:
Vetenskapsrådet
- Diarienummer hos finansiär: 2018-02752
- Projektnamn på ansökan: Clinical and experimental studies of tolerance mechanisms in the thymus aiming at the development of therapeutic targeting of the thymus in the treatment of autoimmune diseases
Data innefattar personuppgifter
Ja
Data innehåller känsliga personuppgifter
Ja
Typ av personuppgifter
Humandata. Data är pseudonymiserade och innhåller ID-nummer som kan kopplas till person via kodnyckel.
Kodnyckel existerar
Ja
Etikprövning
Göteborg - dnr 217-12
Projektnamn: Studier av central toleransutveckling i human thymus
Analysenhet
Population
Isolerade thymocyter från sju personer studerades. Försökspersonerna var tre pojkar och fyra flickor, alla under 3 år, som genomgick korrigerande hjärtkirurgi för medfödda hjärtmissbildningar.
Studiedesign
Experimentell studie
Urvalsmetod
Studie kopplad till biobank
Studien har samlat in nya prover/material som bevaras i en vetenskaplig samling eller biobank
Namn på vetenskaplig samling/biobank: Biobank Väst 890
Typ(er) av prov: Thymusvävnad
Studien har använt befintliga prover/material från en vetenskaplig samling eller biobank
Geografisk utbredning
Geografisk plats: Sverige
Björn Gylemo, Antonio Lentini, Christina Lundqvist, Maike Bensberg, Alessandro Camponeschi, Dora Goldman, Aida Selimović, Olov Ekwall, Colm E. Nestor. (2022). A landscape of X-inactivation during human T-cell development [submitted manuscript].
:
Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.
Tillhörande dokumentation
Patient characteristics meta.tsv
RNAseq_normal_karyotype_meta.tsv
RNAseq_turner_thymocyte_meta.tsv
md5_checksums/EPIC_methylation_checksums.tsv
md5_checksums/RNAseq_normal_karyotype_checksums.tsv
md5_checksums/RNAseq_turner_thymocyte_checksums.tsv
md5_checksums/WES_STANDARD_checksums.tsv
... Visa mer..Beskrivning
Datasetet innehåller data från manuskriptet "A landscape of X-inactivation during human T-cell development in the thymus" av Gylemo et al och innehåller resultat från RNA-sekvensering (fastq.gz), analys av DNA-metylering (Grn.idat) och DNA-exomsekvensering (fastq.gz) av sex olika mognadsstadier av thymocyter från totalt sju individer.
Data är beskrivna på individ- och celltypsnivå i de bifogade tabbseparerade metadatafilerna (.tsv).
Kontrollsummor i MD5-format för datafilerna finns tillgänglig
Version 1
https://doi.org/10.5878/frw5-wd59
Citering
Ladda ner citering
Dataformat / datastruktur
Numeriska
Text
Skapare/primärforskare
Olov Ekwall
- Göteborgs universitet, Institutionen för kliniska vetenskaper, Avdelningen för pediatrik
Antal individer/objekt
7