Skapare/primärforskare
Thomas Kieselbach
- Umeå universitet, Kemiska institutionen
Christiane Funk - Umeå universitet, Kemiska institutionen
Beverley Green - University of British Columbia, Biological Sciences Building
Otilia Cheregi - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap
Beskrivning
Växter och alger har utvecklat olika ljusskördningsmekanismer för optimal leverans av excitationsenergi till fotosystemen. Kryptofytalger har utvecklat en ny löslig ljusuppsamlingsantenn som använder phycobilinpigment för att komplettera den membranlokaliserade Chl a / c-bindande LHC-antennen. Denna nya antenn består av den plastidkodade ß-subenheten, en relik från förfädernas phycobilisome och en ny kärnkodad α-underenhet som är unik för kryptofyter. Tillsammans bildar dessa proteiner den aktiva a1p · α2β-tetrameren.
I alla hittills undersökta kryptofytalger har a-subenheterna duplicerat och diversifierats till en stor genfamilj. Även om det finns transkriptionella bevis för expression av alla dessa gener, antyder de röntgenstrukturer som hittills bestämts att endast två av α-underenhetsgenerna uttrycks signifikant på proteinnivån.
Med proteomik visar vi att i phycoerythrin 545 (PE545) av Guillardia theta, den enda kryptofyten med ett sekvenserat genom, uttrycks alla 20 a-subenheter när algerna växer under vitt ljus. Uttrycksnivån för varje protein beror på intensiteten hos tillväxtljuset,
Språk
Engelska
Forskningshuvudman
Diarienummer hos huvudman
Finns inte
Ansvarig institution/enhet
Kemiska institutionen
Identifierare
Data innefattar personuppgifter
Nej
Forskningsområde
VETENSKAP OCH TEKNOLOGI
(CESSDA Topic Classification)
Naturvetenskap, Kemi, Biologi, Biokemi och molekylärbiologi, Botanik
(Standard för svensk indelning av forskningsämnen 2011)
Biologi och ekologi
(INSPIRE ämnesklassificering)
Nyckelord
proteomik, botanik, fotosyntes, cryptophyta, mikroalger, energiresurser, guillardia theta, phycobilin
Kieselbach T, Cheregi O, Green BR, Funk C. Proteomic analysis of the phycobiliprotein antenna of the cryptophyte alga Guillardia theta cultured under different light intensities. Photosynth Res. 2018 Mar;135(1-3):149-163. DOI:10.1007/s11120-017-0400-0
DOI:
https://doi.org/10.1007/s11120-017-0400-0
Om du publicerat något baserat på det här datamaterialet, meddela gärna SND en referens till din(a) publikation(er). Är du ansvarig för katalogposten kan du själv uppdatera metadata/databeskrivningen via DORIS.
Åtkomst till data via
Kontakt
Thomas Kieselbach
Beskrivning
I dataset ingår alla 45 rådatafiler från masspektrometrianalysen (LC-MS/MS) av de kulturer från algen Guillardia theta som undersöktes i studien. Dessa filer har Waters raw-format och kan processas med kommersiell mjukvara som t.ex. ProteinLynxGlobalServer 3.0 och Mascot Distiller 2.5. De alger som odlades under ljus med optimal intensitet analyserades i NL-serien. De alger som odlades under ljus med hög intensitet analyserades i HL-serien, och de alger som odlades under ljus med låg intensitet
... Visa mer..Dataformat / datastruktur
Text
Övrigt
Skapare/primärforskare
Thomas Kieselbach
- Umeå universitet, Kemiska institutionen
Christiane Funk - Umeå universitet, Kemiska institutionen
Beverley Green - University of British Columbia, Biological Sciences Building
Otilia Cheregi - Göteborgs universitet, Institutionen för biologi och miljövetenskap